Da beide System unabhängig von einander existieren gibt es keine Einflüsse, die das eine oder andere System beeinträchtigen, es sei denn du installierst dir dann Tools, die zwischen den beiden Welten agieren, wie ntfs Treiber unter os x, dann konnte es durchaus vorkommen, das es Probleme geben könnte( wohlgemerkt könnte) und die sind dann meistens anderer Art als eine Verlangsamung des Systems.